Certaines vaches sont-elles génétiquement susceptibles à la paratuberculose?

Pour les producteurs laitiers, cette maladie entraîne des pertes financières associées à la réduction de la production laitière, une diminution des taux de gestation, une hausse des mises à la réforme prématurées et des effets sur le bien-être animal global. Les pertes économiques annuelles associées à la paratuberculose pour le secteur laitier canadien ont récemment été estimées à 21,5 à 34,1 millions de dollars^[1].

Le pathogène principal causant la paratuberculose est Mycobacterium avium de la sous-espèce paratuberculosis (MAP). Des outils de gestion sont en place pour réduire la propagation de la paratuberculose au Canada. Par exemple, en mettant en œuvre le volet Biosécurité de proAction^MD, les producteurs laitiers travaillent avec leur vétérinaire en vue d’atténuer les risques d’introduire des maladies animales existantes et émergentes dans leur ferme et ainsi de protéger la santé du troupeau. Cependant, il est difficile de contrôler la paratuberculose en raison de la progression imprévisible de la maladie et de la faible sensibilité des tests diagnostiques.

Des recherches antérieures ont montré le potentiel de la sélection de bovins génétiquement résistants à la paratuberculose pour réduire la prévalence de cette maladie chez ces animaux. Cette application novatrice pourrait servir de complément aux outils utilisés par les producteurs de pair avec les stratégies de gestion visant à prévenir les infections.

Sur une période de cinq ans, Nathalie Bissonnette et ses collaborateurs ont recueilli des échantillons de sérum et de fèces sur 3 150 vaches. L’équipe a utilisé ces données ainsi que d’autres tests diagnostiques pour définir un système de classification et identifier les animaux comme étant infectés et infectieux, infectés et présumés résistants, ou sains (sans trace d’infection). Avec cet ensemble de données unique, l’équipe a pu modéliser le profil de vaches résistantes à la paratuberculose et de les différencier de celles qui, accompagnées d’une excrétion marqué du pathogène dans leur fumier, développeraient ultimement la paratuberculose. Les chercheurs génotypent également des vaches au moyen de deux méthodes de génotypage éprouvées (c.-à-d. le panel de polymorphismes mononucléotidiques [SNP] et le génotypage par séquençage) et analysent également le profil épigénétique des vaches susceptibles. À ce jour, l’équipe a identifié des marqueurs génétiques et épigénétiques associés à la susceptibilité de développer la paratuberculose.

Dans des publications récentes, les chercheurs ont confirmé la présence de modifications génétiques^[2],[3] et les effets épigénétiques^[4],[5],[6] associés à la paratuberculose. De plus, des analyses ont été menées afin d’étudier les marqueurs in vitro^[7],[8] et la tolérance immunitaire à la paratuberculose au moyen de macrophages primaires bovins^[9]. D’autres recherches sont en cours sur une deuxième population de vaches laitières et confirmeront l’utilité des marqueurs génétiques en vue d’une sélection basée sur la tolérance/résistance à la paratuberculose.

L’équipe étudie aussi la diversité génétique des souches de MAP à l’aide d’outils validés^[10] et classifie les variants de MAP provenant d’animaux présentant différents profils de la maladie et ce, de plusieurs fermes au Canada. Ces analyses permettront de définir quels facteurs affectent le rendement de tests diagnostiques et expliquent la progression de la maladie. Ces travaux en cours visant à identifier des variants de MAP qui pourraient être plus virulents seront fondamentaux dans le cadre du développement d’un programme de vaccination fructueux.