10 ans de sélection génomique : et ensuite?

C’est il y a dix ans, en août 2009, que les évaluations génomiques ont été publiées officiellement pour la première fois au Canada. La technologie a d’abord été appliquée dans la race Holstein, et ensuite dans les races Jersey, Ayrshire, Suisse brune et Guernsey. Jetons un bref coup d’œil à la façon dont la génomique a changé la sélection des bovins laitiers et à son impact sur l’amélioration génétique, et envisageons ce qui se profile à l’horizon.

Sélection et utilisation des taureaux

Presque immédiatement après l’introduction de la génomique, les compagnies d’I.A. de par le monde ont apparemment été contraintes à l’adopter. Compte tenu de la concurrence féroce entre les entreprises, dès que l’une d’elles a décidé d’utiliser la sélection génomique de façon intensive, les autres ont dû faire de même pour maintenir leurs activités. La science démontrait que la génomique n’était pas une « mode » et que la technologie avait progressé au point où l’ADN pouvait finalement être utilisé pour la sélection des bovins laitiers. Le plus grand avantage que la génomique a apporté aux compagnies d’I.A. était la précision accrue de l’information génétique accessible avant toute prise de décision concernant l’achat de taureaux. De plus, la génomique permettait l’utilisation de pères et de mères plus jeunes comme parents de la prochaine génération de jeunes taureaux, sans pour autant sacrifier la précision. Ensemble, ces avantages entraînaient un taux de croissance annuel sans précédent du mérite génétique moyen des jeunes taureaux admis en I.A. partout en Amérique du Nord, qui excède maintenant 120 points d’IPV et 200 $ Pro$ par année. Avec cette constante impulsion, d’une année à l’autre, du matériel génétique des jeunes taureaux génomiques offerts par l’entremise des compagnies d’I.A., ces taureaux représentent maintenant les deux tiers de la part totale du marché de la semence au Canada.

Hausse du progrès génétique

Un résultat direct et très significatif de la disponibilité des évaluations génomiques au cours des dix dernières années est son impact sur la hausse du taux de progrès génétique. La Figure 1 illustre très clairement cet impact puisque le taux constant de gain annuel avant la génomique, qui était de 46 points d’IPV et de 79 $ Pro$ par année, a soudainement changé après 2009. Au cours des cinq dernières années, le taux moyen de gain génétique a augmenté de l’ordre de 2,2, atteignant 102 points d’IPV et 180 $ Pro$ chaque année. Les lignes pointillées depuis 2009 dans la Figure 1 reflètent le progrès génétique prévu qui aurait été atteint à la fois pour l’IPV et Pro$ chez les animaux Holstein canadiens si l’avènement de la génomique n’avait pas eu lieu.

Revêtant une importance égale, ou peut-être même plus grande, que ces gains réalisés pour l’IPV et Pro$ est l’impact que la génomique a eu sur le progrès génétique réalisé dans les caractères individuels, comme l’indique la Figure 2. Le premier point clé à considérer est que le gain génétique positif est maintenant réalisé pour tous les principaux caractères de production et de conformation et les caractères fonctionnels, en plus de Pro$ et de l’IPV et ses trois composants. Avant la génomique, en plus de perdre du terrain pour la Fertilité des filles, la Persistance de lactation, le Tempérament de traite et le composant Santé et Fertilité de l’IPV, très peu de progrès génétique était accompli pour les autres caractères, dont les différentielles de Gras et de Protéine, la Vitesse de traite, l’Aptitude des filles au vêlage et la Résistance aux maladies métaboliques. Pour les onze autres caractères illustrés à la Figure 2, le taux moyen de gain génétique réalisé a augmenté du double. Le résultat vraiment remarquable maintenant connu est que la génomique offre une occasion sans précédent d’atteindre des objectifs de sélection en vue d’obtenir des caractères à plus faible héritabilité même s’ils ont des corrélations génétiques négatives avec des caractères à héritabilité modérée ou plus élevée.